MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-1

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011780	AAAT	2	8	8274	8281	75 %	25 %	0 %	0 %	218875345
2	NC_011780	TTA	2	6	8364	8369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875345
3	NC_011780	TAA	3	9	8373	8381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875345
4	NC_011780	AAG	2	6	8385	8390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875345
5	NC_011780	AAG	2	6	8402	8407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875345
6	NC_011780	A	6	6	8533	8538	100 %	0 %	0 %	0 %	218875345
7	NC_011780	TAAT	2	8	8552	8559	50 %	50 %	0 %	0 %	218875345
8	NC_011780	A	6	6	8577	8582	100 %	0 %	0 %	0 %	218875345
9	NC_011780	A	6	6	8584	8589	100 %	0 %	0 %	0 %	218875345
10	NC_011780	TAA	2	6	8616	8621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875345
11	NC_011780	TAG	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875345
12	NC_011780	A	6	6	8646	8651	100 %	0 %	0 %	0 %	218875345
13	NC_011780	AT	3	6	8669	8674	50 %	50 %	0 %	0 %	218875345
14	NC_011780	TAA	3	9	8676	8684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875345
15	NC_011780	AGA	2	6	8685	8690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875345
16	NC_011780	A	6	6	8690	8695	100 %	0 %	0 %	0 %	218875345
17	NC_011780	AT	3	6	8765	8770	50 %	50 %	0 %	0 %	218875345
18	NC_011780	TC	3	6	8771	8776	0 %	50 %	0 %	50 %	218875345
19	NC_011780	A	7	7	8796	8802	100 %	0 %	0 %	0 %	218875345
20	NC_011780	A	6	6	8832	8837	100 %	0 %	0 %	0 %	218875345
21	NC_011780	A	7	7	8855	8861	100 %	0 %	0 %	0 %	218875345
22	NC_011780	CAA	2	6	8920	8925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875345
23	NC_011780	AAG	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875345
24	NC_011780	AAATT	2	10	8954	8963	60 %	40 %	0 %	0 %	218875345
25	NC_011780	TAGAAA	2	12	8993	9004	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218875345
26	NC_011780	AT	4	8	9011	9018	50 %	50 %	0 %	0 %	218875345
27	NC_011780	A	7	7	9053	9059	100 %	0 %	0 %	0 %	218875345
28	NC_011780	AGA	2	6	9077	9082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875345
29	NC_011780	A	6	6	9116	9121	100 %	0 %	0 %	0 %	218875345
30	NC_011780	ATA	2	6	9155	9160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875345
31	NC_011780	ATAAA	2	10	9191	9200	80 %	20 %	0 %	0 %	218875345
32	NC_011780	ATT	2	6	9230	9235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875345
33	NC_011780	ATT	2	6	9278	9283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875345
34	NC_011780	TAA	2	6	9315	9320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875345
35	NC_011780	TAAA	2	8	9345	9352	75 %	25 %	0 %	0 %	218875345
36	NC_011780	TTA	2	6	9382	9387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875350
37	NC_011780	TCAAAA	2	12	9395	9406	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218875350
38	NC_011780	A	6	6	9403	9408	100 %	0 %	0 %	0 %	218875350
39	NC_011780	A	8	8	9417	9424	100 %	0 %	0 %	0 %	218875350
40	NC_011780	A	7	7	9429	9435	100 %	0 %	0 %	0 %	218875350
41	NC_011780	AT	3	6	9475	9480	50 %	50 %	0 %	0 %	218875350
42	NC_011780	TAA	2	6	9519	9524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875350
43	NC_011780	T	6	6	9541	9546	0 %	100 %	0 %	0 %	218875350
44	NC_011780	TAA	2	6	9567	9572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875350
45	NC_011780	A	6	6	9575	9580	100 %	0 %	0 %	0 %	218875350
46	NC_011780	AATTT	2	10	9587	9596	40 %	60 %	0 %	0 %	218875350
47	NC_011780	ATG	2	6	9614	9619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875350
48	NC_011780	TA	3	6	9630	9635	50 %	50 %	0 %	0 %	218875350
49	NC_011780	ACA	2	6	9691	9696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875350
50	NC_011780	A	6	6	9790	9795	100 %	0 %	0 %	0 %	218875350
51	NC_011780	TAA	2	6	9836	9841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875350
52	NC_011780	AT	3	6	9859	9864	50 %	50 %	0 %	0 %	218875350
53	NC_011780	GGA	2	6	9892	9897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218875350
54	NC_011780	A	7	7	9903	9909	100 %	0 %	0 %	0 %	218875350
55	NC_011780	A	8	8	9917	9924	100 %	0 %	0 %	0 %	218875350
56	NC_011780	ATA	2	6	9930	9935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875350
57	NC_011780	G	6	6	9953	9958	0 %	0 %	100 %	0 %	218875349
58	NC_011780	ATT	2	6	9981	9986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875349
59	NC_011780	TAA	2	6	10010	10015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875349
60	NC_011780	A	6	6	10014	10019	100 %	0 %	0 %	0 %	218875349
61	NC_011780	TAC	2	6	10104	10109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875349
62	NC_011780	CAAA	2	8	10138	10145	75 %	0 %	0 %	25 %	218875349
63	NC_011780	AAAT	2	8	10156	10163	75 %	25 %	0 %	0 %	218875349
64	NC_011780	AAT	3	9	10161	10169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875349
65	NC_011780	AAG	2	6	10213	10218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875349
66	NC_011780	ATT	2	6	10238	10243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875349
67	NC_011780	A	8	8	10256	10263	100 %	0 %	0 %	0 %	218875349
68	NC_011780	TAAT	2	8	10267	10274	50 %	50 %	0 %	0 %	218875349
69	NC_011780	AAT	3	9	10272	10280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875349
70	NC_011780	ATTG	2	8	10292	10299	25 %	50 %	25 %	0 %	218875349
71	NC_011780	CCT	2	6	10305	10310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218875349
72	NC_011780	AGA	2	6	10421	10426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875349
73	NC_011780	TTA	2	6	10480	10485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875349
74	NC_011780	A	7	7	10526	10532	100 %	0 %	0 %	0 %	218875349
75	NC_011780	TTAA	2	8	10584	10591	50 %	50 %	0 %	0 %	218875349
76	NC_011780	AAG	2	6	10639	10644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875349
77	NC_011780	A	6	6	10772	10777	100 %	0 %	0 %	0 %	218875344
78	NC_011780	GAT	2	6	10791	10796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875344
79	NC_011780	AAG	2	6	10829	10834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875344
80	NC_011780	GAATT	2	10	10861	10870	40 %	40 %	20 %	0 %	218875344
81	NC_011780	TA	3	6	10882	10887	50 %	50 %	0 %	0 %	218875344
82	NC_011780	A	6	6	10899	10904	100 %	0 %	0 %	0 %	218875344
83	NC_011780	A	6	6	10926	10931	100 %	0 %	0 %	0 %	218875344
84	NC_011780	TGA	2	6	10934	10939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875344
85	NC_011780	A	6	6	10947	10952	100 %	0 %	0 %	0 %	218875344
86	NC_011780	TAG	2	6	11063	11068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875344
87	NC_011780	TAGA	2	8	11197	11204	50 %	25 %	25 %	0 %	218875344
88	NC_011780	A	6	6	11217	11222	100 %	0 %	0 %	0 %	218875344
89	NC_011780	GAA	2	6	11244	11249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875344
90	NC_011780	A	6	6	12302	12307	100 %	0 %	0 %	0 %	218875347
91	NC_011780	T	6	6	12358	12363	0 %	100 %	0 %	0 %	218875347
92	NC_011780	ATTCA	2	10	12369	12378	40 %	40 %	0 %	20 %	218875347
93	NC_011780	AAC	2	6	12420	12425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875347
94	NC_011780	AAG	2	6	12442	12447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875347
95	NC_011780	ATA	2	6	12462	12467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875347
96	NC_011780	A	8	8	12493	12500	100 %	0 %	0 %	0 %	218875347
97	NC_011780	T	6	6	12616	12621	0 %	100 %	0 %	0 %	218875347
98	NC_011780	ATT	2	6	12658	12663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875347
99	NC_011780	A	6	6	12678	12683	100 %	0 %	0 %	0 %	218875347
100	NC_011780	AAAC	2	8	12726	12733	75 %	0 %	0 %	25 %	218875347
101	NC_011780	TAA	2	6	12734	12739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875347
102	NC_011780	TAA	2	6	12779	12784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875347
103	NC_011780	ATTAA	2	10	12789	12798	60 %	40 %	0 %	0 %	218875347
104	NC_011780	TTAA	2	8	13041	13048	50 %	50 %	0 %	0 %	218875353
105	NC_011780	GAA	2	6	13073	13078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875353
106	NC_011780	GAA	3	9	13092	13100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875353
107	NC_011780	A	7	7	13112	13118	100 %	0 %	0 %	0 %	218875353
108	NC_011780	AGA	2	6	13124	13129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875353
109	NC_011780	A	8	8	13134	13141	100 %	0 %	0 %	0 %	218875353
110	NC_011780	ATTT	2	8	13354	13361	25 %	75 %	0 %	0 %	218875351
111	NC_011780	T	6	6	13359	13364	0 %	100 %	0 %	0 %	218875351
112	NC_011780	A	7	7	16634	16640	100 %	0 %	0 %	0 %	218875342
113	NC_011780	AAT	2	6	16645	16650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875342
114	NC_011780	TCA	2	6	16689	16694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875342
115	NC_011780	TAA	2	6	16765	16770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875342
116	NC_011780	TCA	2	6	16824	16829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875342
117	NC_011780	ATAA	2	8	16844	16851	75 %	25 %	0 %	0 %	218875342
118	NC_011780	C	7	7	16861	16867	0 %	0 %	0 %	100 %	218875342
119	NC_011780	TAA	2	6	16915	16920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875342
120	NC_011780	CAA	2	6	16966	16971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875342
121	NC_011780	TCT	2	6	17043	17048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218875342
122	NC_011780	AAC	2	6	17076	17081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875342
123	NC_011780	A	7	7	17144	17150	100 %	0 %	0 %	0 %	218875342
124	NC_011780	TTA	2	6	17178	17183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875342
125	NC_011780	ATTTTT	2	12	17201	17212	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	218875342
126	NC_011780	TCG	2	6	17238	17243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218875342
127	NC_011780	AAT	2	6	17246	17251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875342
128	NC_011780	ATT	2	6	17280	17285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875342
129	NC_011780	TAT	3	9	17306	17314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875342
130	NC_011780	AAC	2	6	17318	17323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875342
131	NC_011780	A	6	6	17337	17342	100 %	0 %	0 %	0 %	218875342
132	NC_011780	TATT	2	8	17344	17351	25 %	75 %	0 %	0 %	218875342
133	NC_011780	AATTT	2	10	17361	17370	40 %	60 %	0 %	0 %	218875342
134	NC_011780	CT	3	6	17396	17401	0 %	50 %	0 %	50 %	218875342
135	NC_011780	GAT	2	6	17412	17417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875342
136	NC_011780	ATT	2	6	18876	18881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875348
137	NC_011780	A	6	6	19554	19559	100 %	0 %	0 %	0 %	218875346
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.